Организационная структура системы противоэпидемической защиты населения включает медицинские и немедицинские силы и средства. Важную роль в обеспечении противоэпидемического режима играют исполнители немедицинского профиля. Комплекс различных по характеру и направленности мероприятий, связанных с очисткой населенных пунктов, питанием, водоснабжением и т.д., выполняют государственные органы, учреждения, предприятия при активном участии населения. Исполнение целого ряда противоэпидемических мероприятий осуществляют лечебно-профилактические учреждения. Санитарно-эпидемиологическая служба главным образом управляет этой деятельностью. Она включает диагностическую (эпидемиологическая диагностика), организационную, методическую и контрольную функции. Исполнительская функция санитарно-эпидемиологических учреждений ограничивается проведением отдельных мероприятий по иммунопрофилактике и дезинфекции, противоэпидемической работой в очаге инфекции. Сложность управленческой деятельности санитарно-эпидемиологических учреждений заключается в том, что для борьбы с инфекционными заболеваниями требуется привлечение сил и средств, учреждениям не подчиненных.
Санитарно-эпидемиологическую службу Республики Казахстан возглавляет Комитет государственного санитарно-эпидемиологического надзора, который до 2009 года не имел своих подразделений в регионах, чтобы реализовать свою основную задачу – обеспечение санитарно-эпидемиологического благополучия населения на всей территории Республики Казахстан.
В свое время, санэпидслужба в стране была единой, но в последствии была реорганизована и ее подразделения были переданы местным исполнительным органам. В итоге это негативно сказалось на работе системы санэпидслужбы в целом, так как структура ее была несовершенна, в силу ее раздробленности и подчиненности разным уровням государственного управления (республиканский и местный).
В целях создания эффективной системы государственного санитарно-эпидемиологического надзора, в рамках реализуемой административной реформы Министерством здравоохранения в течение 2007–2008 года проводилась работа по восстановлению вертикальной структуры государственного управления санитарно-эпидемиологической службой Республики Казахстан.
Эта задача была реализована с 1 января 2009 года путем передачи государственных органов и организаций санитарно-эпидемиологической службы областей, городов Астана и Алматы из ведения местных исполнительных органов в подчинение Комитета государственного санитарно-эпидемиологического надзора. Централизация функции в области санитарно-эпидемиологического благополучия населения предусмотрена Законом Республики Казахстан «О внесении изменений и дополнений в некоторые законодательные акты Республики Казахстан по вопросам совершенствования бюджетного процесса», а перераспределение бюджетных средств между уровнями государственного управления Законом Республики Казахстан от 4 декабря 2008 года «О республиканском бюджете на 2009 – 2011 годы».
Вертикальная структура государственного управления санитарно-эпидемиологической службой позволит:
• обеспечить проведение единой политики в области обеспечения санитарно-эпидемиологического благополучия населения на районном, областном и республиканском уровнях;
• повысить эффективность осуществляемого государственного санитарно-эпидемиологического надзора;
• добиться снижения неинфекционной заболеваемости, связанной с недостаточным и нерациональным питанием, воздействием неблагоприятных факторов окружающей среды;
• направить усилия на расширение международного сотрудничества в вопросах развития иммунопрофилактики, санитарной охраны границ от заноса особо опасных инфекций, в том числе неизвестной этиологии.
В настоящее время все организационные вопросы по работе санитарно-эпидемиологических служб областей, городов Астана и Алматы в «новом формате» завершены.
В дальнейшем предстоит создать компактную и мобильную структуру санитарно-эпидемиологической службы республики в рамках дальнейшей реализации административной реформы путем оптимизации и совершенствования ее структуры.
Санитарно-эпидемиологическая служба Республики Казахстан представляет единую систему, в которую входят государственные органы, а также организации санитарно-эпидемиологической службы.
1.К государственным органам санитарно-эпидемиологической службы относятся:
1. уполномоченный орган в области санитарно-эпидемиологического благополучия населения, его территориальные подразделения на Государственной границе и на транспорте;
2. местные исполнительные органы областей (города республиканского значения, столицы);
3. подразделения государственных органов, осуществляющие деятельность в области санитарно-эпидемиологического благополучия населения.
2.Организациями, входящими в санитарно-эпидемиологическую службу, являются:
1. республиканская санитарно-эпидемиологическая станция;
2. государственные организации, осуществляющие санитарно-эпидемиологическую экспертизу на Государственной границе, на территориях, транспорте, а также государственная организация осуществляющая санитарно-эпидемиологическую экспертизу при проведении официальных мероприятий с участием должностных лиц государства;
3. республиканские научно-исследовательские организации, осуществляющие в соответствии с законодательством Республики Казахстан деятельность в области санитарно-эпидемиологического благополучия населения;
4. государственные противочумные учреждения.
Проведение проверок объектов государственного санитарно-эпидемиологического контроля должностными лицами санитарно-эпидемиологической службы