Мушкетов был прекрасным учителем, он увлекал своими лекциями слушателей. И не случайно, что многие из них пошли по пути любимого профессора. В числе его учеников был знаменитый впоследствии путешественник и геолог Владимир Афанасьевич Обручев. Умер Иван Васильевич Мушкетов в 1902 году, в возрасте всего 52-х лет. Всю жизнь он отличался богатырским здоровьем и почти никогда не болел; не знала перерывов и его кипучая деятельность. Однако когда он заболел воспалением легких, то болезнь оказалась роковой, и жизнь ученого оборвалась.