4 марта 1801 года Джефферсон стал третьим президентом США, а Бэрр - третьим вице-президентом. Таким образом, полковник Аарон Бэрр оказался исключен из активной политики, так как вице-президент не имел никакой власти. Он только председательствовал на заседаниях сената, который и сам не имел тогда никакой власти. Джефферсон же сделал все, чтобы окончательно добить Бэрра, и не взял его даже в напарники на следующих выборах, а об обещании впоследствии поддержать Бэрра на президентских выборах он больше никогда не вспоминал. Бэрр попробовал выставить свою кандидатуру на выборах губернатора штата Нью-Йорк, но против него работала вся машина правительства, а также его старый враг Гамильтон. С незначительным перевесом выборы он все же проиграл.
Но Гамильтон во время кампании позволил себе несколько личностных и оскорбительных выпадов в адрес Бэрра. Конфликт между ними обострялся и в конце июня 1804 года состоялся вызов на дуэль. По просьбе Гамильтона дуэль отложили на две недели и назначили на 22 июля 1804 года. Эти две недели Гамильтон использовал с толком и сумел так натравить некоего Сэмюэля Брэдхерста на Бэрра, что новая дуэль оказалась неизбежной. Они дрались на шпагах, и, хоть Брэдхерст был значительно выше Бэрра, к разочарованию Гамильтона дуэль закончилась кровопусканием соперника Бэрра. Других препятствий к дуэли Бэрр-Гамильтон не было. Гамильтон стрелял первым и промахнулся. Выстрел Бэрра поразил печень Гамильтона и позвоночник. После ранения Гамильтон прожил еще полтора дня. После смерти Гамильтона вся республиканская пресса, которая только что травила Гамильтона, подняла такой вой против Бэрра, как будто это была единственная дуэль в США. Хотя современники и признавали, что никто не заставлял Гамильтона драться на дуэли с Бэрром, но открыто в его защиту почти никто не выступил. Возможно, что гибель на дуэли прославила и обессмертила Гамильтона, так как его политическая звезда уже закатывалась, и он мог остаться одним из многих деятелей Революции и ранней республики. А так... Его портрет даже попал на двухдолларовую банкноту 1977 года выпуска. Тираж небольшой, но тоже слава.
Политическая карьера Бэрра на этом закончилась. В 1807 году Бэрру предъявили обвинение в государственной измене за попытку присоединения испанских владений. Обвинение не было доказано и Бэрра освободили. Но это уже другая история, о которой я, может быть, расскажу в другой раз.