К чиновничьему сословию принадлежали и преемники Баранова, посланные ему на замену Главным правлением РАК по его многочисленным просьбам.
25 августа 1816 г. специальный совет при Главном правлении компании принял решение назначить главой колониальной администрации капитан-лейтенанта Л. А. Гагемейстера. С этого времени пост главного правителя Русской Америки стал замещаться исключительно офицерами Военно-морского флота обычно в чине капитана 1-го или 2-го ранга.
Назначенный в 1854 г. главным правителем капитан 1-го ранга Степан Васильевич Воеводский в августе 1856 г. был произведен царем в контр-адмиралы за умелое руководство вверенными ему колониями в суровые годы Крымской войны. Избежать тогда разорения Русской Америки англо-французской эскадрой удалось благодаря ловкости Главного правления РАК, сумевшего накануне войны заключить сепаратный пакт о нейтралитете с британской Компанией Гудзонова залива.
Естественная зависимость колоний от морских офицеров, командовавших кораблями РАК, получила свое логическое завершение в передаче им всей полноты исполнительной власти в Русской Америке спустя почти 20 лет после образования Российско-Американской компании.
В результате прихода к власти в колониях морских офицеров были ликвидированы многие права купеческой вольницы, улучшилось положение как русских, так и особенно местных жителей, в том числе алеутов и креолов, находившихся на службе компании. Впрочем, вскоре обнаружились и серьёзные недостатки. Морские офицеры назначались правителями колоний на небольшие сроки, смотрели на свое пребывание в Америке как на временное явление. Хотя они и были знающими, честными и добропорядочными людьми, как правило, они не очень хорошо разбирались в коммерции, и экономические дела компании после смены Баранова оставляли желать лучшего.
Приход к власти в колониях морских офицеров был только началом качественного перерождения высшей руководящей элиты РАК. Основы для этого были заложены при переводе Главного правления из Иркутска в Санкт-Петербург, что позволило сосредоточить большое число акций РАК в руках столичного чиновничества, офицерства и царских сановников, которые уже к концу 1810-х гг. стали активно влиять на решения, принимаемые общим собранием акционеров — высшим органом компании. Несмотря на перевод Главного правления из Иркутска в Петербург, крупные пакеты акций РАК продолжали находиться в руках сибирского купечества.
Влияние придворной знати и бюрократии сказалось в большей степени при учреждении в 1804 г. специального временного комитета (в 1813 г. он был преобразован в официально действующий совет) из трех акционеров РАК для решения политических вопросов, не подлежавших огласке. Причем один из членов этого органа не избирался, а назначался в обязательном порядке из состава Министерства иностранных дел. Первыми членами «политического» комитета стали видные государственные деятели — тогдашний морской министр адмирал Н. С. Мордвинов, заместитель министра внутренних дел граф П. А. Строганов и представитель МИД тайный советник И. А. Вейдемейер.
При самом учреждении компании в 1799 г. планировалось, что её Главное правление должно состоять из двух директоров, но уже в 1800 г. их число увеличилось до четырёх. Избирались они на общем собрании акционеров РАК, имевших право голоса (то есть владевших не менее 10 акциями). Право быть избранными на пост директора получали только лица, владевшие не менее 25 акциями. Поскольку первоначально каждая акция стоила более 1000 руб., то естественно, что попасть в состав руководства компании могли только очень состоятельные люди. Власть директоров была весьма значительна, и простые акционеры не могли вмешиваться в их деятельность и оспаривать распоряжения: для этого необходимо было организовать общее собрание акционеров, что было достаточно непростым делом.
За неполных 70 лет управления Русской Америкой со стороны Российско-Американской компании состав её руководящей элиты претерпел весьма существенные изменения. Если первоначально руководство РАК в колониях и в метрополии состояло исключительно из купцов, пусть и тесно связанных с государственными структурами (а в России иначе и быть не могло), то уже спустя 20 лет после основания РАК власть в колониях перешла в руки морских офицеров. Ещё почти через 15 лет только из них начинают рекрутироваться их заместители. Проходит ещё немногим более 10 лет, и купцы окончательно теряют контроль над Главным правлением, а спустя десятилетие и вовсе исчезают из состава директоров РАК. Такая эволюция была фактически отражением трансформации самой компании, проделавшей за этот период путь от купеческой организации под эгидой Министерства финансов к государственному Департаменту по управлению заморскими территориями в виде своеобразного ответвления Морского министерства.
С середины 1840-х гг. высший управленческий аппарат Российско-Американской компании окончательно превращается в специфическую полугосударственную структуру. Именно военно-бюрократическая монополия лучше всего соответствовала сложившемуся в империи общественному строю. Этот строй достиг своего апогея к середине XIX в. и, в значительной мере исчерпав внутренние резервы своего развития, начал быстро сдавать позиции в пореформенной России. Ни РАК в целом, ни её управленческая элита не захотели и не смогли учесть веяний новой капиталистической эпохи, не успели приспособиться к новым реалиям, переведя экономику Русской Америки на «капиталистические рельсы», что повлекло за собой ухудшение финансового положения компании в 1860-е гг. Таким образом, процесс огосударствления, бюрократизации высшей управленческой элиты РАК явился одной из косвенных причин продажи Аляски США в 1867 г. и последующей ликвидации самой Российско-Американской компании, что пока не нашло должного отражения на страницах отечественной и зарубежной историографии.
При содействии российского правительства компания в 1804—1840 организовала 25 экспедиций, в том числе 15 кругосветных (И. Ф. Крузенштерна, Ю. Ф. Лисянского и др.).
4. Посольства в Японию
С именем Российско-Американской Компании связаны первые в истории России попытки установить торгово-экономические отношения с Японией. Япония начала XIX в. была закрытой страной, фактическая власть в которой принадлежала феодальному роду Токугава, известному своей непримиримой политикой по отношению к иностранцам. Согласно указам сёгуната никто кроме голландцев не имел право вести торговлю на территории Японии. Тем не менее даже голландская торговля, для которой был отведён порт Нагасаки, находилась под строгим контролем чиновников сёгуната. История знает немало примеров попыток западных государств установить торговые и политические контакты с токугавской Японией, однако все они заканчивались неудачами. В подобной обстановке "закрытых дверей" со стороны Японии Российско-Американская Компания решила направить туда свою экспедицию для открытия новых рынков сбыта промышленных товаров. Возможно, что в качестве ещё одной основной задачи, стоявшей перед РАК, было подписание договора, по которому рассчитывалось поставлять в Дальневосточные регионы Российской Империи японские товары. Деятели РАК видели в этом более удобный способ обеспечить провиантом один из стратегически важных регионов страны.
29 июля 1802 г. главное правление РАК обратилось к Александру I для получения разрешения на отправку из Кронштадта первой русской кругосветной экспедиции, с целью доставить в свои тихоокеанские владения припасы и необходимые для кораблестроения материалы. Основной целью было установление торговли с Китаем и Японией, а затем и распространить сферу своей деятельности и на соседние страны.Для этого компания просила обеспечить её опытными офицерами и приказчиками, а также суммой денег в размере 250 тыс. рублей.
Александр I утвердил предложение в тот же день. Начальником экспедиции был назначен И.Ф.Крузенштерн, а его помощником стал капитан-лейтинант Ю.Ф.Лисянский. В распоряжении историков имеется записка царю министра коммерции Н.П.Румянцева "О торге с Японией". "Сама природа, поставя Россию сопредельно Японии и сближая обе империи морями, даёт нам перед всеми торговыми державами преимущества и удобность в торговле, к которой ныне купечество наше, как кажется, ожидает токмо единого от правительства одобрения".
В день отплытия экспедиции Александр I лично посетил корабли компании "Нева" и "Надежда", чем подчеркнул значение, которое придавалось посольству. Экспедиция закончилась в 1805 г., когда "Надежда" покинула японские берега, так и не сумев преодолеть желание японских чиновников сохранять закрытое положение страны. Однако был и ряд положительных моментов. Так например, участники экспедиции смогли собрать для Академии Наук коллекцию образцов флоры и фауны Японии, изделий ремесла, одежды, утвари, что дало мощный толчок научному изучению Японии в нашей стране. Кроме того, экспедиция способствовала ознакомлению двух соседних народов , подготовила почву для их дальнейшего сближения и подписания Симодского договора о начале торговли в 1856 г.
5. Русские на Гавайях
В 1816 году доктор Шеффер, сотрудник Российско-американской компании, прибыл на остров Кауаи с миссией по вызволению захваченного корабля «Беринг» и по личной инициативе добился подписания прошения о протекторате правителем острова Каумуалии, вассалом монарха Гавайского королевства Камехамехи I. Впоследствии император отказался ратифицировать договор[8]. Шефферу удалось построить на острове три крепости, руины одной из которых — Елизаветинской — сохранились до наших дней.