Смекни!
smekni.com

Теоретические основы использования компьютерных программ в биологии (стр. 7 из 7)

d. Клавиатура (Area By Keys). Контур измеряемой фигуры рисуется при помощи клавиатуры. Нажмите левую кнопку мыши в стартовой точке и при помощи кнопок со стрелками ↑, ↓, ← и → обозначьте на изображении контур объекта, используя масштабируемый предварительный просмотр. Вернувшись достаточно близко к стартовой точке, нажмите Enter. Контур замкнется и будет подсчитана его площадь и выдан результат, который можно отправить на печать или в Базу Данных.

Для подсчета элементов используется Меню подсчет и классификация (Count). Эта опция Count and Classification используется для автоматического распознавания объектов на изображении, их подсчета и получения характеристик по каждому объекту. Объекты разделяются на основе яркости оттенков серого, которые можно определить вручную либо автоматически программой. Желательно чтобы объекты имели яркость отличную от фона и как можно сильнее отличались от других частей изображения. Подсчитанные объекты могут быть также классифицированы на основе результатов их измерений.

Выбор объектов

Доступны три режима выбора объектов по яркости / оттенку:

Вручную (Manual):

Выберите этот режим, если хотите самостоятельно установить диапазон яркости для обнаружения объектов.

Автоматически, яркие объекты (Automatic Bright):

Выберите этот режим, если хотите, чтобы программа автоматически обнаружила объекты по яркости / оттенку серого в предположении, что объекты светлее, чем фон изображения.

Автоматически, темные объекты (Automatic Dark):

Выберите этот режим, если хотите, чтобы программа автоматически обнаружила объекты по яркости / оттенку серого в предположении, что объекты темнее, чем фон изображения.

Цвет и Номер

Номера объектов могут быть закодированы в псевдоцвете при помощи окна Палитры.

Классификация

Четыре класса могут быть созданы и подсчитаны при выборе пороговых размеров.

Выполнение подсчета элементов:

·Загрузите изображение для анализа.

·Выберите нужную калибровку.

·Откройте модуль Подсчет и Классификация – Count and Classification.

·Выберите один из трех режимов выделения объектов для анализа.

·Нажмите ОК после выбора псевдоцвета.

·Выберите один или большее количество классов для разделения по размерам объектов.

·Нажмите Показать для связывания псевдо-номера с объектами и измените, если нужно, псевдоцвет.

·Общие параметры Количество, Максимальный / Минимальный периметр, Максимальная / Минимальная площадь отображаются наряду с параметрами каждой частицы (Длина, Ширина, Площадь, Периметр, Соотношение Размеров) в окне результатов.

·Может быть создан и распечатан отчет (Report).

·Для пересылки результатов в формат таблиц нажмите Ms Excel (To Excel).

·Для построения графика распределения измеренных классов нажмите Graph.

Упражнение 4. Формирование отчета

Все модули содержат кнопку Отчет (Report). Для получения распечатки или передачи результатов на любую другую платформу или для сохранения результатов кликните Отчет (Report).

· Будет отражена информация о препарате: Name – Имя, Evaluation Date – Дата выполнения, Sample ID No. – Номер пробы, Application – Применение, Operator – Оператор, Microscope Object – Микроскопический объект.

· Заполните все поля с информацией об отдельном препарате.

· Кликните показать отчет (Show Report) для получения распечатки.

· Предварительный просмотр доступен с информацией о препарате, промышленными стандартами, единицами измерения, исходным и обработанным изображениями.

· Для печати кликните иконку с принтером.

· Результаты могут быть трансформированы в другой формат, основанный на Windows, нажатием иконки Конвертировать (Envelope). Список доступных форматов будет показан.

Перенос результатов в базу данных:

· Для переноса результатов в базу данных кликните по кнопке Add to Data (Добавить к данным), расположенной в Информация о препарате (Sample Information).

· Появится сообщение об успешном переносе результатов.

· Закройте все формы, которые открыли.

· Кликните по пункту Company (Название компании), расположенной в панели текст.

· Кликните по пункту Copy Database (Копировать базу данных)

· Результаты будут переданы в базу данных.

· Результаты могут быть просмотрены при нажатии на кнопку Database Option (Опции базы данных).

· Полный отчет доступен для предварительного просмотра в каталоге Show Report (Просмотр отчетов).

· База данных всех отчетов доступна в формате MS Excess.


Заключение

Проанализировав теоретический материал и изучив на опыте практическую значимость исследования компьютерных программ (Bio Vision, Excel) используемых в биологии можно сделать вывод, что описанные программные средства могут быть широко применены при подготовке разного рода документов, рефератов, диссертаций. Bio Vision – новое поколение программного обеспечения для анализа микроскопических изображений, упрощающее исследователям процедуру анализа. Это гибкая система, адаптированная к разным картам захвата изображений, камерам и микроскопам. Позволяет работать с цветными изображениями, монохромными и с оттенками серого. Использование компьютерных программ Microsoft Office Excel 2007 включает в себя широкий спектр возможностей для создания электронных таблиц, диаграмм, графиков. Вооружает пользователя мощными средствами для упорядочения и анализа деловых данных. Исследовав теоретический и практический материал можно сделать вывод, что данные программы необходимы мне для написания рефератов по различным предметам, научных статей и диссертации. Однако BioVision- это основная программа по биологии.


Литература

1. Лекции и лабораторные работы по теме реферата;

2. Ресурс интернет www.3dnews.ru;

3. Ресурс интернет www.citforum.ru;

4. Сайт производителя ПО Officewww.microsoft.com;

5. Руководство пользователя ПО BioVision