Древесная растительность представлена в основном из ели Шренка. Площадь еловых лесов составляет 65.7 тыс. га. Еловые леса распространены преимущественно на северных и близлежащих к ним склонах гор. окаймляющих озёра. На северном склоне Тескей Алатоо небольшие массивы еловых лесов начинаются с запада (примерно, у села Бокомбаево) и простираются до долины реки Тюп на востоке. Более густые массивы еловых лесов встречаются в долине рек Жууку, Чонкызылсуу, Жетиогуз, Ырдык, Каракол, Аксуу, Бозучук, Тургенаксуу, Жыргалан. На южном склоне хребта Кунгей Алатоо ель распространена между долинами рек Чонаксуу и Чонорукту. Именно эти еловые леса с оригинальными разнотравьями - эдельвейсом жёлтым, геранией скальной, астрой Введенского, фломисом Горолюбивой, тюльпаном Колпаковского и другими цветковыми растениями привлекают любителей природы и являются одной из предпосылок для развития горного туризма.
В степях низкогорий, где степная растительность занимает господствующее положение, массовыми являются такие злаки, как типчак вазелийский, ковыли, житняк гребневидный, тонконог стройный и суховыносливые разнотравье: полыни тяньшаньская и боротальская брутняк. С ним в виде густых зарослей и отдельными кустами часто встречается карагач многолистый. В степях Тяньшаня, кроме того, очень характерны полынь разноцветковая, ковыль Крылова, горькуша Ларионова. Из кустарников обычны жимолость-подражательница, барбарис коликарский. В более сухих вариантах степей преобладают полыни, а злаки занимают подчинённое положение. Проективное покрытие почвы растениями составляет от 20-30% в сухих, до 100% в луговых степях. Степные территории Иссык-Кульской котловины используются как весенние и осенние пастбища. Луговые травостои, существующие за счёт дополнительного грунтового увлажнения (берега рек, озёр, выходы грунтовых вод), встречаются по всему высотному профилю. В степном, полупустынном и особенно в пустынном поясах они нередко засолены. Здесь произрастают солевыносливые виды, такие как бескислица, волосенец многостебельный, овсяница восточная, костёр безостый, тысячелистник обыкновенный, астрагал тибетский. В наиболее влажных засоленных участках произростают осока джунгарская, толстолобиковая, пузырчатая, поручейница водяная, мяты-полевая и азиатская, лютик ползучий и др.
Лекарственные растения Иссык-Кульской области: Иссык-Кульский корень, алтей, белена чёрная, гармала обыкновенная, горец перечный, горец почечуйный, донник лекарственный, душица обыкновенная, зверобой, облепиха крушиновидная, мать и мачеха, подорожник ланцетный, горная смородина, шиповник, эфедра, тимьян зеравшанский, облепиха и др.
В пределах области встречаются 11 видов высших цветковых растений занесённых в Красную книгу республики. В котловине это - аир, ирный корень, чесниэлня волосистая, тюльпан Колпаковского. сибирячка тяньшаньская, девясил высокий; в пределах сыртовых нагорий - соссюрея обернутая, барбарис кашгарский, тяньшаньская зонтиконосная, копеечник киргизский, ветреница туполопастная. Растительность котловины подвержен мощному, с годами увеличивающемуся антропогенному прессу, уменьшению. На территории области находятся 2 ботанических заказника - «Байдамтал» и «Тюпский» и 1 лесной «Кичи». Общая площадь естественных пастбищ области 1 млн. 371 тыс.га, в том числе 606 тыс.га летних, 403 тыс.га весенне-осенних и 362 тыс.га зимних. Горные ущелья, покрытые тяньшаньской елью, эндемичная растительность, лекарственные растения создают красивую природу и являются одним из самых важных критериев, привлекает туристов. Животный мир области включает 50 видов млекопитающих, 11 - пресмыкающихся. 285 - птиц. 4 -земноводных, 31 - рыб, около 10 видов беспозвоночных и около 10 видов позвоночных - эндемиков Тяньшаня. Большинство рыб относятся к эндемикам Ыссыккуля. Фауна в целом сравнительно молодая, сложилась в современном виде в четвертичном периоде. Бассейн озера Ыссыккуль образует Ыссыккульский зоогеографический округ, состоящий из озёрного, предгорного и среднегорного участков. Озёрный участок включает береговые и водные сообщества. Встречаются около 100 видов водоплавающих и околоводных птиц. Из них гнездятся гагара, поганка, волчок, чёрный аист, нырок, обыкновенная чайка, чайконосая крачка. Большое число видов обитает здесь, зимует, а некоторые птицы улетают в другие края. Это серые цапли, лебеди (кликун и шипун), серый гусь, чайки (серебристая, сизая, хохотун) и другие. Ыссыккуль - крупнейшее незамерзающее озеро Центральной Азии - является местом зимовки водоплавающих и околоводных птиц международного значения. В их число входят нырок, лысуха, почанка, кряква, лебеди, серые гуси, казарки, крохали. В озере обитают 11 аборигенных рыб - пескарь, гольян, голый осман, маринка, чебак, чебачок, губач, сазан, тяньшаньский голец и 10 акклиматизированных. Ыссыккульская форель, радушная форель, сиговые, судак, линь, лещ и др. Сазан, форель, судак, чебак и чебачок являются объектами любительского лова.
Среднегорный участок населяют сообщества горных степей, субальпийских лугов, скал, кустарников, лесов и рек. Здесь обитают 32 вида млекопитающих: землеройки, заяц-толай, белка, серый сурок, лесная мыть, серый хомячок, волк, лисица, медведь, барсук, рысь, кабан, косуля, марал. Из 152 видов птиц характерны лесные: корицы, перепелятник, канюк, чеглок, тетерев, кеклик, вяхирь, ушастая сова, дрозды, синицы и др.
Высокогорные участки занимают большую часть территории и отличаются сравнительной однородностью. Из млекопитающих характерны: толай, барс, большеухая пищуха, серый сурок, тушканчик прыгун, слепушонка, медведь, волк, горностай, манул, горный козёл, тяньшаньский баран. Из птиц: огарь, бородач, чёрный гриф, белоголовый сип, кумай, улар, скальный голубь, скальная ласточка. Охотничье-промысловое значение в высокогорье могут иметь горный козёл, заяц, горностай, ласка, серый сурок, волк, лисица, памирский подвид архара (т.н.баран Марко Поло), кекелик, улар, голуби - сизый и скальный.
Для соблюдения равновесия в экосистеме и сохранения численности популяции в Ыссыккульской области созданы разного рода заповедники, заказники и егерские участки, которые играют большую роль в развитии туризма, в частности экотуризма. Природа Сарычатээрташского заповедника одна из особо уникальных территорий Ыссыккульской области. Заповедник расположен в долине между Тескей Алатоо и хребта Акшыйрак. Площадь - 72 тыс.га. Через долину протекает река Сарычат и вместе с крутыми склонами создаёт вид ущелья. Заповедник был организован специальным постановлением Правительства КР 10 марта 1995 года № 76. Цель заповедника - организация охраны экосистем высокогорных сыртов Центрального Тяньшаня. На территории заповедника обитают архары, илбирсы. лисицы, волки, суслики и т.д. Из птиц -улары, беркуты, кекилики. сороки, горные леи.
Постановлением правительства КР от 20 марта 1997 года № 287 был принят проект организации Иссык-Кульской биосферной территории, в нём предусмотрена помощь международного сообщества с целью сохранения уникальной природы Кыргызстана. Главная цель проекта - разработка важнейших направлений биосферного развития территории в экологическом направлении. Иссык-Кульская биосферная территория работает в 3-х направлениях: в некоторых зонах берёт под охрану природные комплексы; в других ограничивает некоторые виды хозяйствования и в-третьих - разрабатывает социально-экономическое развитие региона без вреда для окружающей среды. В число этих мер входят также развитие оздоровительных и туристических комплексов.
Иссык-Кульская зона делится на: зону ядра, биосферную переходную зону и зону санации. Зона ядра - это неприкосновенные заповедные территории, где запрещена всякого рода хозяйственная деятельность, но разрешено проводить научно-исследовательские работы. Биосферная зона окружает зону ядра. Здесь существует хозяйственная деятельность. Запрещены строительные работы. В переходной зоне ведутся экстенсивные пути сельского хозяйства. Зона санации - территории, требующие восстановления и улучшение нарушенных земель.
Редкими и исчезающими видами, включенными в Красную книгу Кыргызстана, являются медведь, выдра, манул, барс, марал, джейран, тяньшанский баран, розовый и кудрявые пеликаны, чёрный аист, фламинго, горный гусь, лебедь, савка, скопа, орлан - долгохвостый, степной орёл, беркут, бородач кумай, змееяд, тетерев, пчела - плотник, аппалоны.
Животный мир Прииссыккулья отличается эндемичностью, богатством и множеством рыболовных и охотничьих угодий, создаёт все условия рыболовно-охотничьего туризма области.
1.2 Рекреационные ресурсы
Основу рекреационной системы области составляет озеро Иссык-Куль с окружающими его горными ландшафтами.
Иссыккуль не замерзает зимой, оказывает смягчающее влияние на климат региона, вода отличается целебными свойствами, с довольно высокой для горного водоёма температурой. В горах особенно в среднегорье немало мест с выходами минеральных вод, лесными ландшафтами и другими благоприятными условиями, удобными для создания рекреационных учреждений: санаториев, домов отдыха, горно-туристических комплексов, лыжных баз и т.д. Территория Иссык-Куля пригодна и доступна для рекреационной деятельности весь год, но более благоприятный и эффективный летне-осенний период с продолжительным купальным сезоном. Для зимних видов отдыха пригодно восточное Прииссыккулье. Протяжённость пляжной зоны 600км - естественные пляжи 1 и 2 категории. 20 крупных пляжных участков расположены в районах сёл Кошкол, Чоктал, Тамчы. Бостери, Каджысай.
Приисыккулье богато культурно-историческими памятниками. Всего в области учтено несколько тысяч памятников истории и культуры, из них под охраной 320 объектов. Среди них памятники каменного, бронзового и железного веков, Каменные скульптуры, городища и поселения средневековья.