В июле 1916 Колчака произвели в вице-адмиралы и назначили командующим Черноморским флотом. Его корабли, разделённые на несколько отрядов, нанесли ряд ударов по побережью Турции и выставили мины у входа в Босфор. В Севастополе уже готовился десант для захвата Константинополя и босфорских проливов, однако осуществить эту операцию помешала Февральская революция 1917.
В июне 1917 Севастопольский совет попытался арестовать офицеров, заподозренных в контрреволюции, и отобрать у Колчака Георгиевское оружие — вручённую ему за Порт-Артур золотую саблю. Адмирал предпочёл выбросить клинок за борт. Через три недели водолазы подняли ее со дна и вручили Колчаку, выгравировав на лезвии надпись: «Рыцарю чести адмиралу Колчаку от Союза офицеров армии и флота». В это время Колчак, наравне с генералом Л. Г. Корниловым, рассматривался как потенциальный кандидат в военные дикаторы. Именно по этой причине в августе А. Ф. Керенский вызвал адмирала в Петроград, где принудил его подать в отставку, после настоял на его отъезде в в США в составе специальной морской миссии.
Гражданская война
Весной 1918 недолго состоял членом правления КВЖД, командующим русскими вооружёнными силами в Полосе отчуждения.13 октября 1918 прибыл в Омск. Золото было размещено на хранение в тамошнем филиале Госбанка. В мае 1919 года было установлено, что всего в Омске находилось золото на сумму 650 млн. рублей (505 тонн).
4 ноября 1918 Колчака пригласили на должность военного и морского министра в состав Совета министров так называемой «Директории» — находившегося в Омске объединённого антибольшевистского правительства, где большинство составляли эсеры. В ночь на 18 ноября 1918 в Омске произошёл переворот — казачьи офицеры арестовали четырех эсеров-руководителей Директории во главе с её председателем Н. Д. Авксентьевым. В сложившейся обстановке Совет министров — исполнительный орган Директории — объявил о принятии на себя всей полноты верховной власти и затем постановил вручить ее одному лицу, присвоив ему титул Верховного Правителя Российского государства. Тайным голосованием членов Совмина на данный пост был избран Колчак. Адмирал заявил о своём согласии на избрание и первым же своим приказом по армии объявил о принятии на себя звания Верховного Главнокомандующего.
Обращаясь к населению, Колчак заявил: «Приняв крест этой власти в исключительно трудных условиях гражданской войны и полного расстройства государственной жизни, объявляю, что не пойду ни по пути реакции, ни по гибельному пути партийности». Далее Верховный Правитель провозглашал цели и задачи новой власти. Первой, наиболее актуальной задачей называлось укрепление и повышение боеспособности армии. Второй, неразрывно с первой связанной — «победа над большевизмом». Третьей задачей, решение которой признавалось возможным лишь при условии победы, провозглашалось «возрождение и воскресение погибающего государства». Вся деятельность новой власти объявлялась нацеленной на то, чтобы «временная верховная власть Верховного Правителя и Верховного Главнокомандующего могла бы передать судьбу государства в руки народа, предоставив ему устроить государственное управление по своей воле».
Нежелание глубоко вникать в политические вопросы было характерно для Колчака. Он искренне надеялся, что под знаменем борьбы с большевизмом ему удастся объединить самые разнородные политические силы и создать новую твёрдую государственную власть.
Поначалу положение на фронтах благоприятствовало этим планам. В декабре 1918 года Сибирская армия заняла Пермь, имевшую важное стратегическое значение и существенные запасы военного снаряжения. В марте 1919 войска Колчака развернули решительное наступление на Самару и Казань, в апреле заняли весь Урал и приблизились к Волге. Однако Соединённые Штаты, Япония, Великобритания и Франция, несмотря на обещания, неизменно затягивали предоставление остро необходимого Колчаку вооружения, военной техники и снаряжения, не говоря о реальной помощи действующими воинскими контингентами.
Имея в своем распоряжении большую часть золотого запаса России, Колчак не позволял своему правительству использовать золото для стабилизации финансовой системы и борьбы с инфляцией (которой способствовала безудержная эмиссия „керенок“ и царских рублей большевиками). На закупку вооружения и обмундирования для своей армии Колчак потратил всего 68 миллионов рублей. 128 миллионов рублей были им размещены в зарубежных банках, их дальнейшая судьба остается неясной.
31 октября 1919 года золотой запас под усиленной охраной был погружен в 40 вагонов, еще в 12 вагонах находился сопровождающий персонал. Транссибирская магистраль на всем протяжении от Ново-Николаевска (ныне Новосибирск) до Иркутска контролировалась чехами, чьей главной задачей была эвакуация из России. Только 27 декабря 1919 года штабной поезд и поезд с золотом прибыли на станцию Нижнеудинск, где представители Антанты вынудили адмирала Колчака подписать приказ об отречении от прав Верховного правителя России и передать эшелон с золотым запасом под контроль Чехословацкого корпуса. 15 января 1920 года чешское командование выдало Колчака эсеровскому Политцентру, который уже через несколько дней передал адмирала большевикам. 7 февраля чехословаки возвратили большевикам 409 миллионов рублей золотом в обмен на гарантии беспрепятственной эвакуации корпуса из России. Народный комиссариат финансов РСФСР в июне 1921 года составил справку, из которой следует, что за период правления адмирала Колчака золотой запас России сократился на 235,6 миллионов рублей, или на 182 тонны. Ещё 35 миллионов рублей из золотого запаса пропало уже после передачи его большевикам, при перевозке из Иркутска в Казань.
4 января 1920 в Нижнеудинске адмирал А. В. Колчак подписал свой последний Указ, в котором передал полномочия «Верховной Всероссийской Власти» А. И. Деникину. Впредь до получения указаний от А. И. Деникина «вся полнота военной и гражданской власти на всей территории Российской Восточной Окраины» предоставлялась генерал-лейтенанту Г. М. Семёнову.
5 января 1920 власть в Иркутске перешла к эсеро-меньшевистскому Политцентру. 15 января А.В. Колчак, выехавший из Нижнеудинска в чехословацком эшелоне, в вагоне под флагами Великобритании, Франции, США, Японии и Чехословакии, прибывает в Иркутск. Чехословацкое командование, с санкции французского генерала Жанена, передает Колчака представителям Политцентра. 21 января власть в Иркутске переходит к большевистскому ревкому. С 21 января по 6 февраля 1920 ведутся допросы Колчака Чрезвычайной следственной комиссией. 6 февраля Иркутский ревком получает телеграмму о том, что РВС 5-й армии не возражает против расстрела Колчака.
Распространена версия о секретном приказе председателя Совнаркома В. И. Ульянова-Ленина, переданном по телеграфу из Москвы, однако прямых доказательств существования такого приказа нет. Сохранившаяся в архивах записка Ленина датирована лишь 24 февраля 1920 года. Возможно речь там идет об указании Ревкому замести следы и взять ответственность за расстрел Колчака на себя.
В ночь с 6 на 7 февраля 1920 Адмирал А. В. Колчак и председатель Совета министров Российского правительства В. Н. Пепеляев были расстреляны на берегу реки Ушаковки близ Знаменского женского монастыря, их тела бросили в прорубь.
В этих условиях уже в мае войска армии Колчака были вынуждены оставить Уфу, Екатеринбург и Челябинск. Потеря Урала роковым образом сказалось на его судьбе.
2.2.2. Использование золотого запаса Колчаком.
Зимой 1919 г. Красная Армия нанесла белым армиям поражение. Они потеряли много боевой техники и вооружения. Страны Антанты готовили войска А. В. Колчака к контрнаступлению.
Они начали усиленно оснащать их вооружением и всем необходимым для ведения активных боевых действий. Белая армия получила от Великобритании обмундирование и снаряжение на 240 тыс. солдат, сотни тысяч винтовок, пулеметов и миллионы патронов к ним. Франция доставила для белой армии 400 артиллерийских орудий, 1700 пулеметов с боекомплектами и 30 аэропланов. Только США поставили армиям А. В. Колчака около 400 тыс. винтовок, 1 тыс. пулеметов, 2 млн. пар обуви и другие предметы. Много вооружения поступило из Японии.
За все это надо было платить. Представители адмирала пытались возобновить кредиты под неиспользованный остаток царского золота ранее депонированного в Лондоне. Под обеспечение этим золотом были открыты упомянутые выше кредиты царскому правительству. После Октябрьской революции 1917 г. они были закрыты.
Возобновить прежние кредиты не удалось, так как возникли неразрешимые международные правовые проблемы, потому что правительство А. В. Колчака так и не было признано Антантой, Японией и США, Все российским, т. е. правопреемником царского и временного правительства А. Ф. Керенского.
В этой ситуации Колчак принял решение продать часть золотого запаса для финансирования военных поставок. Из многочисленных источников, опубликованных на основе архивных данных видно, что из кладовых Омского отделения Госбанка золото изымалось крупными партиями шесть раз и направлялось во Владивосток для последующей пересылки в Японию, Францию, Великобританию и США. За счет золотого запаса оплачивалась также поставка оружия добровольческой белой армии, которая под командованием генерала А. И. Деникина вела борьбу с Советской властью на европейской части России.
В октябре 1919 г. из Омска во Владивосток была направлена партия золота стоимостью 43,6 млн. руб., т. е. 33,7 т. Золото и охрану разместили в 40 вагонах. При этом в 12 вагонах находилась охрана и сопровождающий персонал. Эшелон с золотом под номером «Литер Д» должен был следовать из Омска во Владивосток Еще 4 ноября Министерство путей сообщения белого правительства дало распоряжение по линии Омской, Томской, Забайкальской и Китайско-восточной железных дорог о беспрепятственном пропуске поезда «Литер Д» во Владивосток. Сотрудникам Госбанка, сопровождающим золотой запас, были выданы проездные документы до Владивостока. Эшелон с золотом и правительство двинулись в сторону Иркутска 12 ноября, т. е. за два дня до того, как в Омске установилась Советская власть.